Fondées en 1926 par Wilhelm Messerschmitt, les Bayerische Flugzeugwerke connaissent rapidement des problèmes techniques et financiers
Après une série de crashs d'appareils expérimentaux et commerciaux, la société est mise en faillite. Elle est tout de même sauvée par un accord avec ses créanciers. La méfiance des opérateurs et des autorités font que la société ne reçoit pratiquement aucune commande; Messerchmitt trouve alors de nouveaux marchés à l'étranger, ce qui n'est pas pour calmer les militaires allemands, qui lui accordent alors un contrat de développement pour six appareils destinés à prendre part au Challenge de Tourisme International de 1934. Les M.37, malgré leurs résultats mitigés à la course, sont renommés Bf 108 Taifun et sont produits en série dès 1935.
La société change de nom en 1938, et devient la Messerschmitt Flugzeugbau GmbH. Pendant la période de réarmement de l'Allemagne, puis pendant la Guerre, Messerschitt construit les fameux Me109 et Me110. Elle produit aussi le premier appareil à réaction, le 262.
(que devient la firme après la guerre?)
En 1968, Messerschmitt est racheté par Bölkow.